Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp12Q6P5B0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms