Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms