Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms