Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mvb12bQ6KAU4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms