Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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