Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Pdzrn3Q69ZS0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Pdzrn3Q69ZS0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Pdzrn3Q69ZS0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Pdzrn3Q69ZS0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzrn3Q69ZS0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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