Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brsk2Q69Z98 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brsk2Q69Z98 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms