Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms