Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2bQ64511 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms