Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtprdQ64487 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PtprdQ64487 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PtprdQ64487 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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PtprdQ64487 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms