Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp4aQ64436 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp4aQ64436 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms