Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tbr1Q64336 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tbr1Q64336 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tbr1Q64336 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Tbr1Q64336 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tbr1Q64336 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tbr1Q64336 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tbr1Q64336 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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