Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irf4Q64287 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms