Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms