Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms