Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PatjQ63ZW7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PatjQ63ZW7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PatjQ63ZW7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PatjQ63ZW7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PatjQ63ZW7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PatjQ63ZW7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PatjQ63ZW7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PatjQ63ZW7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PatjQ63ZW7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms