Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col4a5Q63ZW6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col4a5Q63ZW6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms