Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms