Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nptx1Q62443 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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