Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndrg1Q62433 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndrg1Q62433 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms