Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtmQ62388 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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AtmQ62388 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtmQ62388 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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AtmQ62388 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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AtmQ62388 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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AtmQ62388 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtmQ62388 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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AtmQ62388 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtmQ62388 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AtmQ62388 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AtmQ62388 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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AtmQ62388 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AtmQ62388 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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