Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5dQ62240 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5dQ62240 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5dQ62240 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5dQ62240 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5dQ62240 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kdm5dQ62240 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5dQ62240 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms