Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six2Q62232 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms