Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga7Q61738 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga7Q61738 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga7Q61738 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga7Q61738 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms