Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms