Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mkrn3Q60764 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms