Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms