Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms