Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms