Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Satb1Q60611 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms