Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Med13Q5SWW4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Med13Q5SWW4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Med13Q5SWW4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Med13Q5SWW4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Med13Q5SWW4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Med13Q5SWW4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Med13Q5SWW4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Med13Q5SWW4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Med13Q5SWW4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Med13Q5SWW4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med13Q5SWW4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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