Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms