Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc1Q5NCF2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms