Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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