Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf38aQ4FK66 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms