Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Carmil2Q3V3V9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms