Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms