Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccdc185Q3V118 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccdc185Q3V118 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ccdc185Q3V118 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc185Q3V118 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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