Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Dnah12Q3V0Q1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnah12Q3V0Q1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms