Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn4Q3UWL8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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