Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms