Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms