Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxred2Q3USW5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms