Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsponQ3UPR9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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SbsponQ3UPR9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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SbsponQ3UPR9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms