Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms