Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms