Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ceacam5Q3UKK2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms