Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms