Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx27Q3UHD6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx27Q3UHD6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx27Q3UHD6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx27Q3UHD6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx27Q3UHD6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx27Q3UHD6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms