Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lrrc58Q3UGP9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms